黑龙江省中医院（黑龙江省中医研究院）的前身是成立于1957年的“黑龙江省祖国医药研究所”，是全国成立最早的省级中医药科研医疗机构之一。随着规模的发展和功能的不断健全，1985年更名为“黑龙江省中医研究院”。为了充分发挥我院的中医医疗优势，1995年经黑龙江省编委批准加挂了“黑龙江省中医医院”的牌匾，同年被评为三级甲等中医医院；现已发展成为集科研、医疗和研究生教育于一体的综合性中医药机构，2001年先后被确定为黑龙江省和哈尔滨市的城镇职工医疗保险定点医院。 2004年获得卫生部、人事部、国家中医药管理局联合授予的“全国卫生系统先进集体”和黑龙江省委授予的“全省小康建设百面红旗集体”荣誉称号。
黑龙江省中医院占地面积5500 m2，建筑面积34700 m2，编制床位450张，实际开放床位453张，专业技术人员和研究人员452人，专业技术人员和研究人员中主任医（药）师（研究员）42人，其中享受政府津贴的19人，名中医和省级名中医13人，副主任医（药、护、技）师（副研究员）114人，中级职称以下人员317人。我院拥有全国著名老中医、博士生导师张琪教授以及郭文勤、王铁良教授，全国著名中药学专家高奎滨、吴秉纯和王伟明研究员，全国百名杰出青年中医、黑龙江省名中医、博士生导师张佩青、王顺教授等在国内外影响较大的一批学科带头人及业务骨干。黑龙江省中医院现有重点专科3个，三级实验室2个，省政府重点学科6个，省中医重点专科8个。40多年来，不仅研制出了“刺五加”、“满山红”、“双黄连粉针”等许多令人瞩目的科研成果和建设了具有广泛影响的肾病、心血管病和针灸等中医重点专科，也为国家培养和输送了一大批的中医药高级人才。
黑龙江省中医院医疗部分设内、外、妇、儿、骨、针灸、推拿、皮肤、肛肠、急症、口腔、眼科等一级临床科室14个，肾病、心病、脾胃、呼吸、脑病等二级专业分科12个，糖尿病、中风、风湿、结石、心肌炎、痛风、白内障等专病诊室14个。设医技科室10个。2001年在原有“全国中医肾病医疗中心”的基础上，心血管病专科又被确定为“全国中医心血管病医疗中心建设单位”，针灸科成为省级重点学科。“全国中医肾病医疗中心”的规模在全国所有中医重点专科中规模少有，有固定床位165张，最多使用床位210张，其肾病中心免疫实验室为国家三级实验室；针灸科设床位100张，并配有功能齐全的现代化康复治疗中心。全院 2003年年门诊量达20多万人次，住院病人7000余人次，全年床位使用率为93.4%。区外患者占14.8%。
黑龙江省中医院建院以来共获得科技成果200多项，其中获部省级以上科技进步奖60多项，现承担部省级以上科技攻关课题50多项。黑龙江省中医院下设的中药研究所为国家中医药管理局中药剂型改革基地，有条件研制和生产多种中药剂型。现已研制出中药新产品30多个并投放市场。现承担的“北药系列产品研发项目”被列入黑龙江省政府百项重点工程，2003年成为八项重点前期项目之一。其研发的“芩百清肺微丸抗支原体项目”被列为国家科技部技术创新基金项目，是开发前景非常好的对抗SARS病毒和抗支原体的新药；2004年又研制出拥有我院自主知识产权的新药“芪风固表颗粒”，并已获得国药准字批号。另外我院还设有天然保健补品厂和一个制药厂，主办《黑龙江中医药》杂志。
在研究生教育方面，黑龙江省中医院拥有中医内科、中药学（包括中药药理和中药药剂）、针灸推拿和中西医结合等5个专业的硕士学位授予权，硕士研究生导师33名，博士研究生导师3名；目前在院就读硕士研究生80多名。我院从1981年就开始招收硕士研究生，至今已有20多年，招收的硕士研究生来自全国各地。1999年我院又被人事部批准为博士后科研工作站。